1.冷卻效果與品種有關  真空冷卻效果與農產品的表體比(表面積與體積之比)有關，表體比大的產品，如菠菜、結球生菜、萵苣、甜玉米等效果十分明顯。對表體比小的產品如黃瓜、番茄、馬鈴薯冷卻效果就較差，但使用帶有噴霧加濕的真空冷卻裝置冷卻，這個問題就可得到改善。

    2.設備成本較高  以往由于真空冷卻裝置的制造成本較高，影響推廣使用。隨著科學技術的進步和配套設備價格的下降，近年來加速了真空冷卻裝置的推廣應用。因為這可從它冷卻速度快，保鮮效果好，設備利用率高等方面得到補償，對農產品出口創匯和優質食品生產，效果尤為明顯。