氣調貯藏的關鍵之一，是調節和控制貯藏環境中的各種氣體的含量，其中最常見的是降氧和升高二氧化碳。氣體調節的方法很多，按調節方法和設備不同可以有不同的分類。
1)自然降氧(Modified Atmosphere, MA),即靠果蔬自身的呼吸作用，來改變貯藏環境中的氧和二氧化碳的含19。其特點是工藝簡單，不需要專門的氣調設備。但降氧時間長，貯藏環境中的氣體成分不能較快地達到一定的配比，影響果蔬氣調效果。
2)機械降氧。利用一些機械設備，如制氮機、真空泵等實現快速降氧，使果蔬短時間內進入氣調環境，貯藏過程中，也易將氣體成分調節和控制在相對穩定的狀態。
①充氮降氧。將制氮機產生的氮氣，強制性地充入貯藏環境來置換空氣，或在二氧化碳含量過高時，用以置換二氧化碳，以達到快速降氧和控制適量二氧化碳的目的。
②最佳氣體成分置換。人為地將氧、二氧化碳、氮等氣體，按最佳氣體成分指標要求，配制成混合氣體，向貯藏環境中充入。充入前，先對貯藏環境抽真空。這種氣調方式貯藏效果最好，但成本高。
③減壓氣調。通過真空泵將貯藏環境中一部分氣體抽出，同時將外界空氣減壓，加濕后輸入。貯藏期間，抽氣和輸氣裝置連續運行，保證果蔬貯藏在一個低壓環境中。它不同于常規改變氣體成分的氣調方式，因為它不是通過降低氧含量來形成低氧環境，而是靠降低氣體密度來產生低氧環境。雖然降氧方式不同，但降氧效果是相同的，只要控制和調節貯藏環境的真空度，就可以得到不同的低氧含量。減壓貯藏對設施的強度和密閉性要求較高。
