庫房的自動控制主要包括庫溫，濕度和融霜控制等項目。

庫溫的自動控制，一般由溫度繼電器(亦稱溫度控制器)和電磁主閥所組成的回路來實現。溫度繼電器的感溫元件安裝在庫房內，當庫溫達到溫度繼電器調定值的下限時，感溫元件發出信號，使繼電器的觸頭斷開，切斷電磁閥電源而使閥門關閉，停止向蒸發器供液和回汽；當庫溫回升至溫度繼電器調定值的上限時，繼電器的觸頭閉合，接通電磁閥電源而使閥門重行開啟，并通過與壓縮機、輔助設備的連鎖配合，使庫溫又開始下降，實現對庫溫的雙位式控制。

濕度的自動控制，一般包括濕度的檢測、加濕控制和減濕控制，以保持室內一定的空氣濕度，這對于貯存鮮蛋、果蔬的冷卻物冷藏間，是非常重要的。若濕度過高，會引起庫內霉菌大量繁殖，使食品發生霉變、腐爛、出芽等病變，甚至影響冷庫的建筑；若其相對濕度過低，則食品的干耗將會增加，并使其色、香、味遭到破壞。所以對冷卻物冷藏間，一定要合理控制濕度，并保持其穩定。

融霜的自動控制：是指設置在凍結間、冷卻物冷藏間內的冷風機融霜，一般有水融霜、水和熱氨結合融霜兩種。自動融霜可以根據風機運轉時間、風壓變化、霜層厚度、電動機電流大小等因素來實現；半自動融霜剛是通過操作人員的觀察與判斷，認為需要融霜時，發出指令，使融霜時間程序繼電器工作，融霜過程自動完成。

目前冷庫中的庫房主要有：(1)凍結物冷藏間（亦稱低溫冷藏間)；(2）冷卻物冷藏間(亦稱高溫冷藏間)；(3）凍結間；(4)冰庫。