微通道換熱器由于其使用場合不同，其結構形式也有較大的不同。

微通道冷凝器由傳熱微管、傳熱翅片以及集(分)流管等組成。圖8-16所示的是微通道冷凝器結構原理圖，由圖8-16可以看出，微通道冷凝器左右兩側有集流管，每個集流管被分割為不等的幾部分，傳熱微管和左右集流管相連，傳熱翅片分布在傳熱微管之間。

微通道冷凝器的制冷劑蒸氣由經分流管分配到傳熱微管，經與傳熱微管相焊接的翅片與空氣換熱后匯聚到集流管。傳熱微管平行分布于分流管與集流管之間，冷卻空氣流經傳熱微管外的翅片并與其進行熱交換，將制冷劑由氣態冷卻到液態，第一流程中高溫高壓制冷劑蒸氣被吸收過熱及部分冷凝，第二流程中制冷劑完成冷凝并進一步過冷。

從圖8-16還可看出，微通道冷凝器流經每個流程傳熱微管的數量由多到少，充分吻合制冷劑相態變化的需要，即制冷劑進入傳熱微管時呈氣態，管子數多，可減少流動阻力，而隨若冷凝過程的進行，制冷劑比體積逐漸減小并且液態比例提高直至完全液態，其管子數也相應減少。正是微通道冷凝器這種變流程設計，與常規冷凝器相比，其制冷劑側的流動阻力僅為其20%~30%，并且使得其在各階段具有合理的流速和較高的換熱系數，其總體換熱性能較常規銅/鋁翅片盤管換熱器提高10%以上，相同冷卻條件下，其制冷劑的冷凝溫度和阻力損失也大大降低，此外，傳熱微管與傳熱翅片間采用焊接連接也降低了兩者之間的導熱熱阻。